Le palais a été construit entre le XIVe et le XVe siècle comme demeure des Contarini “de San Paternian”, qui, à partir de la fin du XVe siècle, furent surnommés “dal Bovolo” en raison de l'ajout de l'escalier en colimaçon. En 1499, Pietro Contarini (peut-être Pietro di Giovanni, beau-père de Pietro Maria Del Bovolo qui épousa Contarina Contarini en 1502), Marco Contarini et Giovanni Battista Contarini, sénateurs de la Sérénissime République de Venise, firent ajouter un petit corps de bâtiment de style Renaissance vers la cour intérieure, caractérisé par une série de loggias ouvertes avec des arcs en plein cintre ou surbaissés.
Nel 1717 il complesso passò a Giovanni Minelli che aveva sposato Elisabetta di Pietro Maria Contarini, ultima rappresentante della famiglia. All’inizio dell’Ottocento fu acquistato dalla ditta Emery, dalla quale fu affittato ad Arnoldo Marseille che vi aprì nel 1803 un albergo detto “del Maltese” (da qui la denominazione della corte del Maltese sulla quale si affaccia il palazzo). Nel 1852 fu ceduto per testamento alla parrocchia di San Luca e divenne sede della Congregazione di carità.
En 1859, le lithographe Wilhelm Tempel effectua ses premières observations astronomiques depuis le belvédère de la tour, avec un télescope lui appartenant. C'est là qu'il découvrit, le 2 avril 1859, la comète C/1859 G1, et le 19 octobre 1859 la nébuleuse de Mérope dans l'amas ouvert des Pléiades. Le palais appartient toujours à l'IRE de Venise, acronyme pour Istituzioni di ricovero e di educazione.